Hospitais representam um desafio particular para as tecnologias de ventilação e condicionamento de ar. Além das preocupações clínicas, a maior prioridade é a higiene de áreas sensíveis como centros cirúrgicos e unidades de terapia intensiva. O ar condicionado é fundamental devido a razões fisiológicas.
Um bom condicionamento de ar ajuda os pacientes a se recuperarem rapidamente e cria boas condições de trabalho apra os funcionários, como por exemplo durante as operações.
Um condicionamento ótimo é criado através da limitação do nível de microorganismos nas areas que requerem proteção especial, como zonas de operação e mesas de instrumentos. Garantir a vazão e distribuição de ar adequada também é muito importante. Além disso é necessário evitar a concentração de gases narcotizantes e substâncias nocivas e remover as cargas térmicas para manter a temperatura adequada.